首先有些输卵管的先天性疾病会导致不孕，比如先天性输卵管发育不全、输卵管发育异常、单侧输卵管、单角子宫，使受孕机会降低50%。影响比较大的是非先天性疾病，主要指输卵管炎症性疾病引起的输卵管阻塞。各种细菌、支原体等都可能引起输卵管炎症，结核杆菌引起的结核病也会导致输卵管炎症。尤其在寒冷地区，女性因为结核病，患输卵管结核的几率比较高。很多病人的症状是隐匿性的，不明显，但其实已经影响了女性的生育功能。
有些子宫内膜异位症引起的盆腔粘连也会导致输卵管功能障碍，即输卵管不孕。
还有一种情况是过去的女性生育过第一个孩子后，为了避孕会做结扎手术，就是把输卵管扎住，但这种情况现在已经比较少了。
